薬に関する情報（データ）がＷEBに公開されています。
診療報酬情報提供サービス
https://shinryohoshu.mhlw.go.jp/
MEDIS-DC 標準マスター
http://www.medis.or.jp/4_hyojyun/medis-master/index.html
昨今では、公共機関や団体がそのデータに関する商品やサービスの利用を促進する為に、関係するデータを一定の利用条件の元で利用できるよう、インターネットで閲覧出来るWEBサイトに掲載（公開）されています。薬局にもっとも関連があると思われる情報に上記の２つがあります。CSV形式のテキストデータですので、自社システム等に取り込んで利用する事ができると思われます。